Trayectoria
Su debút en la primera xeneize se dio con Carlos Maria García Cambón como entrenador el 31 de mayo de 1998 en un partido frente a Gimnasia y tiro de Salta, correspondiente al torneo Clausura 1998, en la victoria 4-0 de su equipo, donde jugó los últimos 4 minutos del partido, siendo su único partido en dicho torneo.
Previamente a la llegada de Carlos Bianchi, como director técnico de Boca Juniors, Battaglia estuvo a prueba por 1 mes en el Club Deportivo Badajoz de España, pero se quedó a jugar la Copa Mercosur con el xeneize.
En la segunda mitad del año, con la llegada de Carlos Bianchi jugó algunos partidos de la copa mercosur 1998, pero ninguno en el torneo Apertura 1998, relegado por el colombiano Mauricio Serna donde Boca Juniors finalmente saldria campeón luego de 6 años sin poder hacerlo.
En el año 1999 El leon solo jugó 4 partidos en el Torneo Apertura 1999(donde el club se corono nuevamente campeón). En el torneo Apertura de ese mismo año solo jugó 3 partidos.
En el 2000 fue un buen año para Sebastían ya que consigio la titularidad en el equipo debido a la lesion de Serna, y cumplio un buen papel.
Fuente: Prensa Club El Cadi